Флаг школы № 88 – официальный символ муниципального общеобразовательного автономного учреждения «Средняя общеобразовательная школа № 88» г. Оренбурга.
Представляет собой прямоугольное полотнище, разделённое по диагонали от нижнего угла со стороны древка к верхнему углу вольной части; правое треугольное поле горчично-желтого, левое – светло-коричневого цвета. Отношение ширины флага к его длине составляет 2:3.
В центре флага расположена эмблема школы (герб) в кругес белой окантовкой. Внутри круга – символическое изображение четырехлистного клевера белого цвета, верхний левый и нижний правый лепестки имеют так же дополнительный контур горчично-желтого цвета, сердцевины трех его листочков имеют светло-коричневый оттенок, один из лепестков — более насыщенный коричневый оттенок, в чём получил свое выражение официальный девиз школы «Единство всех и уникальность каждого!» Изображение четырехлистного клевера перекликается с цифрами номера школы (88), в которыхтак же угадываются знаки бесконечности ∞.
Внутри клевера находится символическое изображение раскрытой книги белого цвета, по очертаниям напоминающую парящую птицу.
На эмблеме так же располагается наименование образовательной организации и название города – слова «ШКОЛА № 88» в верхней части и «Г. ОРЕНБУРГ»в нижней части эмблемы.
Желтый (золотой), коричневый, белый цвета и их оттенки являются официальными цветами МОАУ «СОШ № 88» г. Оренбурга. Золото (желтый цвет) — символ справедливости и великодушия. Белый цвет — символ чистоты помыслов и поступков. Коричневый цвет — символ храбрости, мужества, благоразумия.
Клевер считается символом жизненной энергии. Четыре лепестка на флаге школы означают творчество, науку, патриотизм и спорт, является знаком избранных, посвященных, бессменным символом удачи.
Раскрытая книга в виде парящей птицы на флаге символизирует образование, стремление к знаниями науке, свободу мыслей.
Первоначальный дизайн флага был разработан дизайнером и программистом Голышевым Павлом, идея принадлежит учителю истории и обществознания школы Хажумарову Марату Ильдаровичу.